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对比|燃石、诺禾 & 世和基因NGS-kits审评报告大解读

字号+ 作者:基因谷 来源:未知 2018-10-11 17:17 我要评论( )

2018年7月23日,NMPA(原CFDA)批准了广州燃石医学检验所有限公司的高通量检测创新产品 人EGFR/ALK/BRAF/K

2018年7月23日,NMPA(原CFDA)批准了广州燃石医学检验所有限公司的高通量检测创新产品 “人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因突变联合检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”的三类医疗器械产品的注册—— “肿瘤NGS第一证”。

 

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很快的,2018年8月13日,NMPA又批准天津诺禾致源“人EGFR/KRAS/BRAF/PIK3CA/ALK/ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)” 的三类医疗器械产品上市。

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燃石与诺禾致源NGS-Kits的相继获批,市场对世和基因、飞朔生物、华因康基因、艾德生物、华大基因的NGS产品也更为关注与期待。终于,2018年9月30日,在这举国欢庆的节日来临之际,NMPA也给基因检测行业送上了一份厚厚的大礼——“EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突变检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”终获NMPA批准。

 

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近日,CMDE公布了世和基因的审评报告,小编进行如下整理汇编。

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▽世和、诺禾&燃石NGS-Kit数据对比

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试剂组成

首先,诺禾产品主要组成成分包括文库构建试剂盒、文库定量试剂盒、模板制备试剂盒、模板制备溶液盒、耗材盒、测序试剂盒、测序溶液盒,共计有7个子试剂盒。相比较,燃石与世和的盒子较为简单,选择将组分中的部分子试剂盒进行一类备案。

其次,世和与诺禾的配套软件均按照III类器械进行注册申报。其中,诺禾的NGS软件已经获批,世和稍显滞后,但也已在审评阶段。而燃石按照II类申报,目前已经注册发补阶段,顺利的话年底可拿证。

 

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适用机型

世和与燃石的盒子都是基于illumina平台,适用机型系MiseqDx。据了解,此型号产品illumina公司在2014年即启动进口注册,刚刚获得NMPA批准。诺禾的盒子是基于中山大学达安基因股份有限公司生产的DA8600,注册证号:国械注准20143401961。

 

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预期用途

本试剂盒用于定性检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者经福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样本中EGFR、ALK、ROS1、BRAF、KRAS、HER2基因的多种变异。其中,EGFR基因19外显子缺失及L858R 点突变用于吉非替尼片及盐酸埃克替尼片的伴随诊断检测,T790M点突变用于甲磺酸奥希替尼片的伴随诊断检测;ALK基因融合和ROS1 基因融合用于克唑替尼胶囊的伴随诊断检测。

 

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▽伴随诊断用途的基因变异类型及相应的靶向药物

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▽未经伴随诊断验证的基因突变类型

世和与燃石的伴随诊断药物相同,均为吉非替尼片、盐酸埃克替尼、奥希替尼以及克唑替尼。诺禾则未对埃克替尼进行伴随诊断研究。

 

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临床研究

>>>>(一)与已上市试剂或金标准方法的比较研究

1、临床机构:中国医学科学院附属肿瘤医院、南京医科大学第一附属医院(江苏省人民医院)、首都医科大学附属北京胸科医院共 3 家。

2、样本例数:入组样本为 960 例非小细胞肺癌样本和 46 例良性组织干扰样本,共计 1006 例有效样本。阳性率95.43%。样本类型为石蜡包埋组织。

本临床试验共检测出 716 例基因变异阳性样本,阳性率为 71.17%(其中 56 例含有大于 1 种基因变异,占阳性样本数的 7.82%)。包括 EGFR 基因中 203 例 19 外显子缺失突变阳性、 192 例L858R 突变阳性、 41 例 T790M 突变阳性、 47例 G719 位点突变阳性及 29 例 L861Q 突变阳性; ALK 基因中 57 例 ALK 基因融合阳性; ROS1 基因中 29 例 ROS1 基因融合阳性; BRAF 基因中 25 例 V600E 突变阳性; KRAS 基因中 97 例 G12 位点突变阳性及 20 例 G13 位点突变阳性;HER2 基因中 32 例 20 外显子插入突变阳性。

 

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▽考核试剂与对照试剂比对数据

3、不一致验证:考核试剂与对比方法结果不一致的样本共 19 例,主要分为两方面原因:(1)8例为考核试剂检测范围超过对比方法;(2)11 例可能为不同检测方法间的差异,其中 3 例为考核试剂检测 HER2 20 外显子插入阳性且突变比例已低于Sanger 测序最低检测限;1 例为对比方法免疫组化检测 ALK基因融合阳性但无法显示具体融合形式;余下 7 例经 Sanger测序验证,6 例结果与考核试剂一致,1 例结果与对比方法一致。

>>>>(二)与伴随诊断试剂的比较研究

试验目的:在一致性临床研究基础上,深入评估考核试剂与已经充分联合药物临床评价的伴随诊断试剂的一致性。

1、EGFR

临床机构:中国医学科学院肿瘤医院、首都医科大学北京胸科医院 ,共计2 家临床机构。

样本类型:入组样本为比较研究(一)中已入组及部分新入组样本,共入组 323 例 NSCLC FFPE组织样本。

2、ALK基因

临床机构:中国医学科学院附属肿瘤医院、南京医科大学第一附属医院(江苏省人民医院)、首都医科大学附属北京胸科医院共 3 家机构。

样本类型:入组样本为比较研究(一)中已入组样本,共入组 1006例 NSCLC FFPE 组织样本。

3、ROS1基因

临床机构:中国医学科学院肿瘤医院及首都医科大学北京胸科医院 2 家临床机构。

样本类型:入组样本为(一)比较研究中已入组及部分新入组样本,共入组 323 例NSCLC FFPE 组织样本。

 

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▽考核试剂与已上市CDx试剂比对数据

其中,针对EGFR19del及L858突变的,世和CDx选择了Roche的cobas EGFR Mutation Test,注册证号:国食药监械(进)字2014第3403340号。诺禾则选择了凯杰Kit,注册证号为国食药监械(进)字2014第3400761号。燃石则选择cobas® EGFR Mutation Test v2。针对T790M位点,世和与燃石、诺禾致源选择的对照品一致,均为Roche的Cobas V2。

针对ALK融合基因,世和基因与燃石、诺禾的选择有所差异,燃石与诺禾选择的均是Abbott的Kit,世和则选择了Roche的VENTANA anti-ALK (D5F3) Rabbit Monoclonal Primary Antibody,注册证号:国食药监械(进)字2014第3403115号。

针对ROS1融合基因,世和选择与诺禾致源的相同,均为厦门艾德的Kit。注册证号:国食药监械(准)字2014第3401514号。此试剂盒虽未获得CNDA批准用于伴随诊断,但在2017年初获得了日本药品和医疗器械管理局(PMDA)批准,成为全球首个ROS1靶向抑制剂克唑替尼(crizontinib)的伴随诊断试剂。

>>>>(三)TKI 药物疗效相关的回顾性临床研究

1、样本例数:共入组有效病例 118 例,其中吉非替尼片 23 例、盐酸埃克替尼片 30 例、甲磺酸奥西替尼片 20 例、克唑替尼胶囊 40 例、盐酸厄洛替尼片 5 例。

2、样本类型:针对“与伴随诊断试剂临床研究”中考核试剂检出的阳性样本。

 

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▽考核试剂TKI 药物疗效相关的回顾性临床研究结果

针对TKI 药物疗效临床研究,世和基因还对厄洛替尼做了回顾性研究,但由于入组病例数未达到统计学要求,故未进行统计分析。

 

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